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生物工程專業培養通過掌握生物技術及其產業化的科學原理、工藝技術過程和工程設計等基礎理論，基本技能，能在生物技術與工程領域從事設計生產管理和新技術研究、新產品開發的工程技術人才。

生物工程主要研究現代生物工程技術及其產業化的原理、工藝過程和工程設計等方面的基本知識和技能，在制藥、農林、食品等領域進行產品研發、生產、質量檢測等。例如：疫苗、抗生素等生物藥物的研制，人工授精、胚胎移植、克隆等生物工程的設計，轉基因食品的研發，雜交水稻的培育等。

《發酵工程》、《生化工程》、《細胞工程》、《基因工程》、《普通微生物學》、《動物學基礎》、《生物信息學》、《生物技術制藥》、《生物分離工程》、《蛋白質工程》 部分高校按以下專業方向培養：食用菌、發酵工程、生物農藥、生物質能源、微生物應用、農業生物技術、食品發酵與生物制劑。

學習生物工程專業的學生可以選擇畢業后去從事醫藥、食品、環保、商檢等部門的技術開發、工程設計、生產管理等工作。醫藥類企業：生物工程、產品研發、生物制藥、技術開發、工程設計、生產管理、藥物檢測； 農林類企業：產品培育、植物組培、去病毒技術； 食品類企業：發酵工程、轉基因技術。